リンクの効果が出るのはメインサイトとリンク元サイトの両方のインデックス(Googleのサイトデータベース)が更新された時ということでしょうか?
リンクの効果が出るときは、リンク元サイトからメインサイトへリンクを貼ったあとサテライトサイトがインデックス更新されたときです。メインサイトは関係ありません。